不一样的。从一下几个方面说一说：
1、补偿标准规定不同：
棚户区的改造补偿：通常是居民补偿，又分为货币补偿和产权置换补偿。产权置换包括1：1.5的面积置换。房屋重置成新价格，即把房屋折算成价格，其与房屋的新旧、装修、结构均有关系。其他的搬迁奖励。
房屋拆迁补偿：指拆迁人对被拆除房屋的所有人，根据规定给予的补偿，拆迁补偿方式包括货币补偿、房屋产权调换，还可以选择货币补偿和产权置换相结合的补偿方式。
2、实施动因不同：
棚户区改造是一项民生工程，目的是要解决住房条件最困难的那部分群众的住房问题，为了消除该区域住房安全隐患，完善配套设施，改善居民生活条件。
房屋征收是为了实现某特定公共利益，比如建公立学校、建高铁、修机场等。棚户区改造只是房屋征收中的一种项目形式。
3、处置对象不同：
棚户区改造针对的是简易房、危房、旧房，通常以住房居多。房屋征收只能在国有土地上进行。
房屋征收包含的内容比较广泛，比如，修高铁占路需要进行房屋征收，棚户区只是对一些基础设施比较落后的小区的统称。对棚户区进行改造时也需要进行房屋征收。
