会的，无论是银行商贷还是公积金贷款，扣款都是电脑系统自动扣款的，第一次扣款不成功的，稍后还会再扣一次的，如果是账户余额不足的，就不能保障贷款人的个人征信了，最好是去公积金管理中心说明情况了！
如果是企业的公积金账户，扣款失败了，要去检查一下是不是账户里的余额不足，尽快补足，公积金系统会再重新扣的（各地时间不一样），如果超过这个月最后缴纳时间，会产生补缴的，会给申请公积金贷款带来一些麻烦；不放心的话可以电话公积金中心。
一、公积金扣款失败的原因
1.公积金中心无法进行扣款。
（1）公积金账户出现被冻结、账户无第三方扣款功能、卡过期、换卡但未激活等情况。
（2）公积金中心系统还贷户名或账号与银行不匹配。例如：借款人在银行变更了还贷户名或账号、借款人变更姓名、银行或者住房公积金中心的系统中借款人姓名错误或有空格等。
当出现上述这些情况时，公积金中心就无法完成扣款。
2.公积金账户资金不足。
扣款时，公积金账户可扣余额小于应还款额，也是不能正常扣款的。
如果说在还款日当天，系统只会自动扣款一次，但是还款银行卡中还款金额不足导致扣款失败了，这样用户就错过了还款时间。用户进入借款页面，一般会有主动还款的选项，输入还款金额，选择还款银行卡，进行支付就可以主动还款了。
如果公积金自动扣款时间过了，您可以采取以下步骤处理：
1.确认扣款失败：首先，确保您的公积金自动扣款确实未成功。您可以通过查看银行账户明细或联系银行客户服务来确认是否有相关的扣款记录。
2.联系公积金机构：如果确实发现扣款未成功，您应该立即联系负责管理您的公积金的机构。这可以是您工作的公司的人力资源部门，或者是地方政府机构，公积金管理中心等。告知他们关于扣款失败的情况，并询问应该采取的下一步行动。
3.补缴公积金：根据公积金机构的指示，您可能需要补缴未成功的公积金款项。通常情况下，公积金机构会告知您如何进行缴纳，包括所需的手续和文件。
4.注意逾期费用：如果公积金扣款未及时缴纳，可能会导致逾期费用的产生。了解公积金机构的逾期费用政策，并确保在指定时间内进行补缴，以免产生额外费用或可能的法律后果。
为了避免类似情况的发生，建议您及时关注扣款时间，并确保账户中有足够的余额用于自动扣款。如果有任何疑问或问题，您可以随时与公积金机构联系以获得准确的指导和帮助。
